姓  名：马峻

导师类别：专硕导师

职称：副教授

职务：

电子邮件：maj@lzufe.edu.cn

2021 2025 兰州大学 信息科学与工程学院，计算机应用技术，工学博士

2008 2011 西北师范大学，计算机应用技术，工学硕士

2001 2005 西北师范大学，计算机科学与技术，工学学士

大数据原理与应用、人工智能、Python程序设计、C语言程序设计

机器学习、深度学习、图神经网络、化学与生物信息学、药物发现、大数据分析；聚焦AI算法在药物 靶点相互作用、分子属性预测方向的交叉应用研究

代表性学术论文

1. Jun Ma; Zhili Zhao; Yunwu Liu; Tongfeng Li; Ruisheng Zhang. Designing an adaptive learning framework for predicting drug target affinity using reinforcement learning and graph neural networks[J]. Engineering Applications of Artificial Intelligence, 2025, 139: 109472 (SCI一区 Top)，第一作者

2. Jun Ma; Zhili Zhao; Tongfeng Li; Yunwu Liu; Jun Ma2; Ruisheng Zhang; GraphformerCPI: Graph Transformer for Compound Protein Interaction Prediction, Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2024, 0(3) (SCI二区)，第一作者，共同通讯作者

3. Jun Ma; Ruisheng Zhang; Tongfeng Li; Jing Jiang; Zhili Zhao; Yunwu Liu; A deep learning method for predicting molecular properties and compound protein interactions, Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2022, 117(12) (SCI四区)，第一作者

4. Yunwu Liu; Ruisheng Zhang; Tongfeng Li; Jing Jiang; Jun Ma; Ping Wang; MolRoPE BERT: An enhanced molecular representation with Rotary Position Embedding for molecular property prediction, Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2023, 118: 108344 (SCI四区)，共同作者

5. Jing Jiang; Ruisheng Zhang; Zhili Zhao; Jun Ma; Yunwu Liu; Yongna Yuan; Bojuan Niu; MultiGran SMILES: multi granularity SMILES learning for molecular property prediction, Bioinformatics, 2022, 38(19): 4573 4580 (SCI三区)，共同作者

6. Tongfeng Li; Ruisheng Zhang; Yabing Yao; Yunwu Liu; Jun Ma; Link prediction using deep autoencoder like non negative matrix factorization with L21 norm. Applied Intelligence, Volume 54, pages 4095–4120, (2024) (SCI三区)，共同作者

1.甘肃省教育厅2026青年博士“入企入园”项目：基于跨尺度图神经网络和注意力的化合物 蛋白质亲和力预测方法研究，项目号：2026QB 057，主持，经费5万元，在研

2.国家自然科学基金地区科学基金项目：多尺度自适应单纯复形表示学习的高阶链路预测理论与方法研究，项目号：62366030，参与，经费33万元，在研

3.甘肃省科学技术厅纵向项目：基于聚类分析的小分子化合物活性预测研究，项目号：21JR7RA460，参与，经费6万元，已结题

网络规划设计师（高级）